В результате исследования, проведённого учёными Тихоокеанского океанологического института им. В.И. Ильичёва ДВО РАН совместно с коллегами из Института биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г.К. Скрябина РАН, установлено, что новая сульфатвосстанавливающая бактерия способна к биодеградации углеводородов. Результаты исследования опубликованы в журнале «Микробиология», а новой бактерии предложено название Desulfosporosinus shakirovi sp. nov, составной частью которого стала фамилия заведующего лабораторией газогеохимии ТОИ ДВО РАН доктора геолого-минералогических наук Рената Шакирова, информирует «Тихоокеанская Россия», ТоРосс.

Новая сульфатвосстанавливающая бактерия (штамм SRJS8Т), обладающая способностью к биодеградации углеводородов нефти, выделена из донных отложений северной части Японского моря.

Клетки новой бактерии представлены грамположительными подвижными одиночными спорообразующими палочками размером 0.4–0.5 × 2.0–5.0 микрометров (мкм). Штамм SRJS8Т рос в диапазоне температуры 6–30°С (оптимум 25°С), рН 6.3–7.7 (оптимум 7.3) и концентрации NaCl от 0 до 20 г/л (оптимум 2 г/л). Штамм SRJS8Т использовал бутанол, глицерин, метанол, этанол, бутират, лактат, пируват, формиат, дрожжевой экстракт, Н2/СО2, сырую нефть в качестве доноров электронов и источника углерода в присутствии сульфата. В качестве акцепторов электронов штамм использовал сульфат, сульфит, тиосульфат, элементную серу, фумарат и Fe(III), но не нитрат, арсенат и ДМСО.
Сравнение фенотипических свойств новой бактерии с таковыми близкородственного вида D. lacus STP12T показывает, что штамм SRJS8Т отличает более низкий температурный оптимум и способность использовать элементную серу и фумарат в качестве акцепторов электронов. Для профиля жирных кислот клеточных стенок штамма SRJS8Т характерно преобладание не только С16:1 и С16:0, как у типовых штаммов близкородственных видов, но и жирной кислоты с болеекороткой цепью (С14:0, 18.1%). Учитывая, что значения ДНК–ДНК гомологии (57.4%) и ANI (93.69%) штамма SRJS8Т с близкородственным видом D. lacus STP12T ниже пороговых значений межвидового барьера 70 и 95–96% соответственно, штамм SRJS8Т отнесен к новому виду рода Desulfosporosinus, для которого предложено название Desulfosporosinus shakirovi sp. nov.

Результаты исследования опубликованы в журнале «Микробиология»:
Еськова А. И., Рыжманова Я. В., Трубицын В. Э., Полоник Н. С., Пономарева А. Л., Щербакова В. А. DESULFOSPOROSINUS SHAKIROVI SP. NOV., СУЛЬФАТВОССТАНАВЛИВАЮЩАЯ БАКТЕРИЯ, СПОСОБНАЯ К БИОДЕГРАДАЦИИ УГЛЕВОДОРОДОВ НЕФТИ // МИКРОБИОЛОГИЯ, 2025, том 94, № 3, с. 264–274.